1、直腸膀胱周期性出血，月經(jīng)期排便疼痛，先應(yīng)考慮直腸膀胱的子宮內(nèi)膜異位癥，必要時可做膀胱鏡或直腸鏡檢查，有潰瘍時還應(yīng)取組織做病理檢查

腹壁疤痕有周期性硬結(jié)疼痛，病史中有經(jīng)腹子宮腹壁懸吊術(shù)、剖腹產(chǎn)或剖宮手術(shù)者則診斷亦可確立。

2、可疑病例經(jīng)藥物治療有效者亦可診斷，凡形成局部腫塊接近體表者盡可能取組織（切取或用肝穿刺針取）送作病理檢查可以確診。

3、B超內(nèi)膜樣囊腫聲象圖呈顆粒狀細(xì)小回聲如囊液粘稠，內(nèi)部漂浮有內(nèi)膜碎片時，易與畸胎瘤內(nèi)脂肪中含有毛發(fā)的回聲特點相似即為液內(nèi)見小細(xì)光帶，呈平行虛線狀分布。有時內(nèi)部見分隔將其分成數(shù)個大小不等的囊腔，各個囊腔之間回聲不一致，常與子宮粘連而兩者邊界不清。

畸胎瘤則一般囊腫邊界清晰。卵巢內(nèi)膜樣囊腫也易與附件炎塊及輸卵管妊娠聲象圖混淆，故應(yīng)結(jié)合臨床各自特點加以鑒別。此外應(yīng)用陰道探頭，使腫塊處于高頻率聲的近場，對位于盆腔腫塊性質(zhì)的鑒別有其優(yōu)越性，可確定腫塊性質(zhì)及來源，還可在超聲指導(dǎo)下穿刺抽取囊液或活檢以明確診斷。

4、腹腔鏡：為診斷內(nèi)異癥的有效方法鏡檢所見新鮮的種植灶呈黃色小水泡；生物活性強的為大焰狀出血灶；大多數(shù)的散在病灶融合成咖啡色斑塊，并向深部植入；骶韌帶增粗、硬化縮短；盆底腹膜疤痕形成，使子宮直腸窩變淺；卵巢種植灶多起于卵巢游離緣及其背側(cè)。

初為1～3mm肉芽狀灶漸漸向卵巢皮質(zhì)發(fā)展，形成巧克力囊，表面呈灰蘭色多為雙側(cè)，相互連粘，倒向子宮直腸窩與子宮、直腸及周圍組織廣泛粘連。Ⅰ～Ⅱ期輸卵管無異常Ⅲ～Ⅳ期卵管跨于巧囊之上被動延長，呈水腫，蠕動受限傘部多正常，通暢或通而不暢。做腹腔鏡時應(yīng)做子宮輸卵管通液術(shù)